山东农业大学党委行政一贯重视马克思主义理论的研究与教育工作。早在1952年就设立了马列主义教研室，1988年3月改建为社会科学部，1999年6月撤部设立文法学院。2000年7月山东水利专科学校社科部并入，2007年7月科技学院基础部政治教研室并入，组成新的文法学院。依据中宣部、教育部关于加强思想政治理论课建设的要求，学校于2010年11月行文拟建马克思主义学院，2011年3月行文建立马克思主义学院。2011年6月，以文法学院马克思主义理论教学部和思想政治教育教学部教师为主体，正式成立直属学校领导的二级教学机构——马克思主义学院。由马克思主义学院统一开设全校思想政治理论课，统一管理思想政治理论课教师，统一负责马克思主义理论学科建设，巩固马克思主义在高校意识形态领域的指导地位。2016年3月，学院被省委宣传部、省委高校工委评为第一批“山东省重点马克思主义学院”。

马克思主义学院现有教职工99人，其中专任教师96人；有教授14人、校聘教授4人、副教授39人；具有硕士及以上学位的教师89人，其中具有博士学位的教师24人；有硕士研究生导师15人。

学院设习近平新时代中国特色社会主义思想概论、马克思主义基本原理、思想道德与法治、中国近现代史纲要、毛泽东思想与中国特色社会主义理论体系概论、形势与政策及研究生思政课等7个教研部。有马克思主义与农业生态文明研究团队、思想政治教育理论与实践创新研究团队和中国特色社会主义农村文化研究团队等3个研究团队。学院拥有“农业生态文明”泰安市社科研究基地和山东高校统战工作理论研究基地等2个研究基地。

学院现有马克思主义理论一级学科硕士学位授权点，下设4个二级学科：马克思主义基本原理与当代中国社会发展研究、马克思主义中国化的理论与实践研究、思想政治教育创新与发展研究及中国近现代史问题研究。

马克思主义学院一方面承担全校本科生和研究生的思想政治理论课和部分人文选修课的教学任务，参与大学生心理健康教育与疏导工作，为我校人才培养发挥思想导航和信念支撑作用；另一方面培养具备系统的专业知识和实践能力、有开放的视野和为社会服务的公共意识、能将马克思主义理论应用于中国特色社会主义现代化实践的高素质研究人才。

今后，学院将认真贯彻落实习近平总书记关于教育重要论述等系列讲话精神，自觉把习近平新时代中国特色社会主义思想贯穿教学和研究全过程，并转化为清醒的理论自觉、坚定的政治信念和科学的思维方法，进一步凝炼学科和学术研究方向，创新人才培养模式，提升思想政治理论课教学实效，在跨越式发展道路上不忘初心、砥砺前行。